长双歧杆菌XY01的基因组学和蛋白质组学分析

作者：陆静; 魏晓; 袁静^*

来源：军事医学, 2018, 42(12): 910-915.

DOI：10.7644/j.issn.1674-9960.2018.12.007

• 长双歧杆菌
• 基因组学
• 蛋白质组学
• α-L-岩藻糖苷酶

目的探究长双歧杆菌XY01(B. longum XY01)的基因组和蛋白质组特点。方法基于基因组学和蛋白质组学测序,比较分析B. longum XY01与常规菌株B. longum NCC2705的碳水化合物代谢特点。通过液相色谱-串联质谱联用技术鉴定该菌株的蛋白质图谱。结果与结论与B. longum NCC2705相比,B. longum XY01的基因组更大,含有一个2 480 603 bp的环状染色体,并含有381个特异编码序列,其中5个与岩藻糖代谢相关,即岩藻糖酸脱水酶(GS0809530和GS0801695)、岩藻糖异构酶(GS0801710)、α-L-岩藻糖苷酶(GS0801715)和L-岩藻糖通透酶(GS0809520)。利用液相色谱-串联质谱联用技术鉴定出B. longum XY01菌株含有1365种蛋白(占预测蛋白组的71. 8%),确定了B. longum XY01的bifid shunt过程和糖酵解通路相关的酶。

• 单位
  首都儿科研究所; 首都医科大学宣武医院