环境微生物的宏基因组学研究新进展

作者：孙欣; 高莹; 杨云锋

来源：生物多样性, 2013, (04): 393-401.

• 宏基因组学
• 生物信息学
• 高通量测序
• 基因芯片 metagenomics
• bioinformatics
• high-throughput sequencing
• GeoChip

宏基因组学以环境中微生物的基因组的总和为研究对象,从而规避了传统方法中绝大部分微生物不能培养的缺陷,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。本文重点介绍了宏基因组学技术中关键的两类技术:即以罗氏454及Illumina为代表的高通量测序技术和以基因芯片(GeoChip)为代表的基因芯片技术在微生物研究中的应用。测序技术可以发现新物种和新基因,但由于测序深度有限,定量性差,不易发现低丰度物种,且易受污染物干扰。芯片技术很好地克服了这些局限,但不易于发现新基因。本文介绍了这些技术近年来在气候变化、水处理工程系统、极端环境、人体肠道、石油污染修复、生物冶金等方面取得的部分代表性成果。在此基础上...

• 单位
  环境模拟与污染控制国家重点联合实验室