1株快速增殖的HAV分离株基因型分析

作者：白冰珂; 胡燕; 邬顺全; 姜棋予; 杨瑞创; 柴燕涛; 李瑞生; 侯俊

来源：传染病信息, 2015, 28(03): 155-159.

• 序列分析
• 甲型肝炎病毒
• 基因型

目的确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点。方法提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对。结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与Gen Bank中收录的HAVⅠ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高(99.4%)。进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近。与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大。结论 HAV302株属于HAVⅠ型中的ⅠB亚型,其2B和2C区的变异可能是导致病毒快速增殖的原因之一。