5S rRNA互作蛋白组研究揭示5S rRNA参与mRNA剪接调控

作者:周祥明; 杨兵; 赖巧; 李乐; 董军; 廖建友; 朱爽*
来源:中山大学学报(自然科学版), 2019, 58(03): 54-62.
DOI:10.13471/j.cnki.acta.snus.2019.03.007

摘要

为系统揭示5S rRNA调控细胞进程的新功能和分子机制,合成了生物素标记探针,利用分子杂交技术特异捕获5S rRBP,并结合高灵敏度质谱技术和生物信息学分析共鉴定出162个5S rRNA互作蛋白。基于ConsensusPathDB和STRING数据库获取蛋白复合体富集信息和构建蛋白与蛋白互作网络,利用GO数据库获取互作蛋白的功能注释,利用KEGG数据库进行通路富集分析。分析结果显示5S rRNA除了与翻译相关蛋白发生互作外,还与大量来自microRNA加工通路、mRNA剪接通路和细胞信号调控通路蛋白有互作。这说明5S rRNA除了具有蛋白质翻译调控功能外,还参与mRNA剪接等过程的调控,为5S rRNA功能和调控机制研究指明了一个新的方向。

全文