基于网络药理学探索锦灯笼诱导结肠癌发生铁死亡的分子机制

作者：谢晓巍; 安娜; 庞德峰; 邢舒^*

来源：哈尔滨医科大学学报, 2023, 57(03): 235-241.

DOI：10.20010/j.issn.1000-1905.2023.03.0235

• 锦灯笼
• 结肠癌
• 铁死亡
• 网络药理学

目的 基于网络药理学探究锦灯笼诱导结肠癌(colon cancer, CC)发生铁死亡的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)、本草组鉴(a high-throughput experiment-and reference-guided database of traditional Chinese medicine, HERB)以及Swiss Target Prediction等数据平台收集锦灯笼的主要活性成分和基因靶点。借助STRING和Metascape数据库构建锦灯笼活性成分靶基因的蛋白互作网络以及功能簇。利用Metascape网站对药物成分的靶点基因进行基因本体论(Gene Ontology, GO)功能注释和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析，并使用微生信作图网站进行可视化。通过Gene Cards数据库收集结肠癌疾病靶点，采用维恩图筛选出锦灯笼抑制结肠癌发生发展的潜在靶点，并进行GO和KEGG富集分析。通过FerrDb数据库收集铁死亡相关靶点，利用维恩图筛选锦灯笼治疗结肠癌与铁死亡的共同靶点，并绘制成分-铁死亡映射关系弦图。结果 通过各种数据库分析筛选出了33个锦灯笼诱导结肠癌发生铁死亡的主要靶点。结论 筛选出了锦灯笼诱导结肠癌发生铁死亡的潜在基因靶点。

• 单位
  哈尔滨医科大学; 哈尔滨医科大学附属第四医院