三种统计指标在IGH免疫组库分析中的应用

作者：王芳; 房建成; 许媛丽; 李婷婷; 刘红星^*

来源：中国免疫学杂志, 2018, 34(11): 1720-1723.

• 免疫组库
• 高通量测序
• 稀疏分析
• Shannon-Wiener指数
• Simpson指数

目的:探讨稀疏分析、Shannon-Wiener指数、Simpson指数在免疫球蛋白重链(IGH)免疫组库分析中的应用。方法:随机选取36例初诊B-ALL患者和15例健康个体,进行IGH V区片段基因扩增和高通量测序。采用稀疏分析、ShannonWiener指数、Simpson指数对两组标本进行免疫组库多样性分析。结果:稀疏曲线可以可视化地展示和区分两组标本IGH V区序列的多样性,患者组IGH V区序列多样性减低。Shannon-Wiener指数、Simpson指数可以用量化指标区分两组标本IGH V区序列的多样性。结论:使用上述三种统计学方法可以将IGH免疫组库的多样性可视化地展现并进行量化分析,可以作为免疫组库分析的部分量化指标。