HLA-A~*0201限制性CTL表位肽的三维定量构效关系的研究

作者：林治华; 胡勇; 吴玉章

来源：Acta Chimica Sinica, 2004, (18): 1835-1840.

• 细胞毒性T淋巴细胞
• 表位
• 肽
• 比较分子力场分析
• 比较分子相似性指数分析

运用比较分子力场 (CoMFA)和比较分子相似性指数分析 (CoMSIA)方法研究了 5 0个HLA A 0 2 0 1限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系 ,另外 15个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力 .结果表明采用CoMSIA得到的构效关系模型 (q2 =0 .62 8,r2 =0 .997,F =840 .419)要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型 .在CoMSIA计算中 ,当引入疏水场时 ,三维构效关系模型得到明显改善 ,通过该三维构效关系模型 ,可较精确地估算预测集中 15个CTL表位肽与HLA A 0 2 0 1间的亲和力 (r2pred=0 .743 ) .通过分析分子场等值面图在空间的分布 ,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽与HLA A 0 2 0 1间结合亲和力的影响 ,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础 .

• 单位
  第三军医大学; 重庆理工大学; 生物工程学院