CXCL2和THBS2在结肠癌诊断、预后及免疫浸润中的生物信息学分析

作者：张雨雁; 陈学军^*

来源：实用肿瘤杂志, 2022, 37(02): 154-162.

DOI：10.13267/j.cnki.syzlzz.2022.025

• 结肠癌
• 生物信息学
• 差异表达基因
• 诊断
• 预后
• 免疫浸润
• CXCL2
• THBS2

目的 通过生物信息学方法，筛选可能与结肠癌诊断、预后及免疫浸润相关的基因。方法 从GEO数据库中下载数据集，并筛选出结肠癌差异基因，通过STRING数据库和Cytoscape软件筛选出核心基因CXC型趋化因子配体2(CXC chemokine ligand 2,CXCL2)和血小板反应蛋白2(thrombospondin-2,THBS2)。通过GEPIA和UALCAN数据库分析CXCL2和THBS2表达水平与预后关系以及其表达与结肠癌患者临床特征之间的关系。TIMER数据库分析CXCL2和THBS2与结肠肿瘤免疫细胞浸润的相关性。LinkedOmics和DAVID数据库分析CXCL2和THBS2基因的正相关基因和KEGG通路。结果 鉴定出结肠癌相关的核心基因16个，包括CXCL2和THBS2。CXCL2和THBS2在结肠癌中的表达均高于正常组织（均P<0.05），且在年龄、性别、分期和淋巴结转移方面比较，差异均具有统计学意义（均P<0.05）。CXCL2高表达组患者5年生存率高于低表达组（P<0.05）,THBS2高表达组患者5年生存率低于低表达组（P<0.05）。CXCL2和THBS2基因参与结肠癌肿瘤细胞的免疫浸润。KEGG通路显示CXCL2主要参与细胞因子受体的相互作用、肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor,TNF）信号通路和趋化因子信号通路等。THBS2主要参与细胞外基质（extracellular matrix,ECM）-受体相互作用、血小板活化和磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositide 3-kinases/protein kinase B,PI3K-Akt)信号通路等。结论 CXCL2和THBS2为结肠癌诊断及预后相关基因，参与多种分子调控通路，可作为结肠癌潜在的生物标志物。

• 单位
  基础医学院; 锦州医科大学