利用TCGA数据集分析PPFIA3在三阴性乳腺癌中的表达及临床意义

作者：王玲玉; 潘跃银^*

来源：癌症进展, 2018, 16(13): 1647-1687.

• 三阴性乳腺癌
• PPFIA3
• 癌症基因组图谱

目的初步探讨PPFIA3在三阴性乳腺癌患者中的表达及临床意义。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载三阴性乳腺癌患者基因表达及临床特征数据,分析PPFIA3表达与患者临床特征的关系及其对预后的影响。通过构建与PPFIA3相关的共表达网络,对共表达基因集进行KEGG信号通路富集分析。结果 PPFIA3在肿瘤组织中的表达水平明显高于癌旁正常组织(P<0.01);T3～4期、淋巴结转移患者的PPFIA3表达水平均高于T1～2期、淋巴结未转移患者(P=0.025、0.027)。生存分析表明PPFIA3高表达的患者中位生存期明显短于PPFIA3低表达的患者(P=0.009)。KEGG信号通路富集分析显示与PPFIA3共表达的基因参与肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂素活化蛋白激酶(MAPK)和雷帕霉素靶蛋白(MTOR)信号通路,氨基糖与核苷酸糖代谢等通路的信号转导。结论 PPFIA3可能通过TNF、MAPK、MTOR等信号通路参与三阴性乳腺癌细胞的增殖、转移等过程,在三阴性乳腺癌中,PPFIA3高表达提示预后不良,其可能作为预测三阴性乳腺癌患者预后的有效生物标志物。

• 单位
  中国科学技术大学; 安徽省立医院