2013-2015年人冠状病毒OC43基因型分布特点的研究

作者：贾宝迁; 肖艳; 王营; 任丽丽; 王健伟

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2016, 30(02): 175-178.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2016.02.016

• 人冠状病毒OC43
• 基因型
• 突变
• 流行

目的研究人冠状病毒(Human Coronavirus,HCo V)OC43的基因型分布特点,为阐明HCo V-OC43的分子流行规律提供数据参考。方法从2013年-2015年HCo V-OC43检测阳性的呼吸道样本中提取核酸,用逆转录方法扩增c DNA,利用特异性引物扩增全长纤突蛋白基因(S)、聚合酶基因(Rd Rp)和核蛋白基因(N)。用Mega 6.0软件进行序列拼接、进化树构建和S蛋白氨基酸比对。结果从16份HCo V-OC43阳性样本中获得全长S、Rd Rp和N基因。其中2013年的1株为D基因型,2014年的8株均为D基因型,2015年的7株中包括3株B、3株D和1株E(CH)基因型。B和D基因型的S蛋白分别有9个和16个氨基酸位点的突变与分离年份有关,B基因型中氨基酸突变呈累加现象,D基因型中出现连续突变和回复突变。结论 HCo V-OC43表现为多基因型共流行,D基因型高流行。抗原蛋白S的氨基酸突变在各基因型流行中起重要作用。本研究为完善和丰富对HCo VOC43的分子流行特征的认识提供了数据参考。

• 单位
  中国医学科学院病原生物学研究所