摘要
锌指类转录因子PLATZ (Plant AT-rich sequence and zinc-binding)广泛存在于植物中,在调控植物生长发育、响应非生物胁迫方面发挥着重要作用。本研究通过对甘薯PLATZ基因进行生物信息学和表达模式分析,在甘薯全基因组中共鉴定出19个IbPLATZ基因,分布在11条染色体上,根据系统进化分析可将IbPLATZ蛋白分为四大类,所包含的motif种类、排列顺序有所不同,但所有蛋白均含有motif1和motif2保守结构域,结构域相对保守。通过共线性分析,IbPLATZ基因家族内存在4对重复事件,其中片段重复3对,串联重复1对,相比于水稻,甘薯和拟南芥之间存在更近的进化关系。启动子顺式作用元件分析表明,IbPLATZ具有多种响应激素和非生物胁迫相关的顺式作用元件。转录组分析显示,不同IbPLATZ基因在组织上呈现差异性表达,高表达的基因主要集中在果实、初生根,非生物胁迫下甘薯差异基因表达主要集中在根部,在茎尖上调表达的基因数量最多。本研究从多个角度分析了甘薯PLATZ基因的基因结构和理化性质,探究了PLATZ基因可能在甘薯生长发育中起到的作用,为甘薯分子育种提供一定理论依据。
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