鹿角灵芝免疫调节蛋白基因的克隆及生物信息学分析

作者：姜芳燕; 李花; 尹乐乐; 马军; 王辉芳

来源：琼州学院学报, 2016, 23(02): 54-59.

DOI：10.13307/j.issn.1008-6722.2016.02.12

• Ganoderma amboinense
• 免疫调节蛋白
• 基因克隆
• 生物信息学

采用同源克隆法,从Ganoderma amboinense 07基因组中成功PCR扩增到编码FIP-gam的全长基因,并进行测序.通过生物信息学分析,可知FIP-gam基因全长333 bp,编码107个氨基酸,理论分子量为12.0 k Da,等电点为4.48.进化树及序列分析结果显示,FIP-gam与灵芝组FIPs同源性较高,而与金针菇、草菇和血红丛赤壳的FIPs同源性较低.采用SWISS-MODEL进行同源建模,结果表明FIP-gam为α-螺旋和β-折叠形成哑铃形的二聚体蛋白.本研究为进一步高效表达FIP-gam及其结构功能关系的研究奠定基础.

• 单位
  海南热带海洋学院