不明原因复发性流产患者全基因组差异甲基化位点分析

作者：宋旭梅^*; 詹福寿; 范美荣; 闫昕; 王青; 随瑞枝

来源：生殖医学杂志, 2023, 32(06): 904-911.

• 复发性流产
• DNA甲基化
• 生物信息学

目的 分析不明原因的复发性流产(URSA)患者全基因组DNA甲基化差异，以探讨其新的病理机制。方法 收集2021年1～10月于宁夏医科大学总医院就诊并明确诊断为URSA的3例患者作为URSA组，选取同期3例孕检无不良孕产史患者作为对照组，采用甲基化芯片技术，检测URSA患者外周血基因组DNA甲基化情况，初步筛查URSA患者的差异甲基化位点(DMCs),并对DMCs对应的基因使用GO(http://www.geneontology.org/)和KEGG(https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html)进行生物信息学分析。结果 URSA患者全基因组共筛选出39 075个DMCs,其中33 634个为高甲基化，5 441个为低甲基化；启动子区域(Tss1500、Tss200、3′UTR、5′UTR、1stExon)有10 941个(28.0%)DMCs, 9 797个为高甲基化，1 144个为低甲基化。两组样本DMCs的层次聚类分析结果显示，URSA患者存在较多高甲基化位点，两组间存在显著的甲基化差异(P<0.05)。Go功能富集分析结果显示，生物进程主要富集在中性粒细胞活化及介导的免疫、细胞黏附正向调节；细胞组分主要富集在细胞连接、特异颗粒等；分子功能主要富集在丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、GTP酶活性调节、肌动蛋白结合等。KEGG分析结果显示，DMGs在多条信号通路上富集，其中主要富集在T细胞受体信号通路。结论 URSA发生可能与DNA甲基化位点的改变有关，主要涉及到细胞免疫、黏附、酶活性调节等多个生物学过程和T细胞受体信号通路的调控。

• 单位
  宁夏医科大学总医院