急性冠状动脉综合征发病机制的单细胞转录组生物信息学研究

作者：朱宝华; 孙艳君; 李敏

来源：四川医学, 2023, 44(09): 957-963.

DOI：10.16252/j.cnki.issn1004-0501-2023.09.012

• 急性冠状动脉综合征
• 稳定性心绞痛
• 单细胞转录组
• 生物信息学

目的 利用单细胞转录组生物信息技术挖掘急性冠状动脉综合征(ACS)发病的潜在机制。方法 从高通量基因表达数据库中下载ACS样本的单细胞转录组数据集GSE184073作为研究对象，利用R语言的Seurat数据包对数据进行过滤和标准化，将具有相似特征基因的细胞进行聚类和注释，筛选与ACS发病相关的细胞亚群，提取差异表达基因，对差异表达基因进行富集分析，挖掘ACS发病的潜在信号通路，下载GSE54977数据集，验证差异基因的表达并筛选ACS发病的核心基因，绘制受试者工作特征曲线评价核心基因预测ACS发病的价值。结果 过滤获得ACS样本细胞1720个，稳定性心绞痛样本细胞1071个，共聚类成10个亚群，ACS样本中单核细胞占比高。筛选获得单核细胞相关的差异表达上调基因56个，差异表达下调基因56个。S100A8、S100A9、S100A12是ACS发病的核心基因。差异表达基因显著富集于肿瘤坏死因子α、核转录因子κB、炎性反应等信号通路。结论 ACS与稳定性心绞痛样本细胞分布存在较大差异，单核细胞与急性冠状动脉综合征发病密切相关，是预防和治疗ACS的潜在靶细胞，S100A8、S100A9、S100A12是ACS发病的潜在核心基因。