一株分离自医院污水的宽裂解谱铜绿假单胞菌噬菌体的生物学特性及基因分析

作者:张旭华; 李琴; 任海燕; 周静茹; 杨芳; 倪萍; 哈晓丹; 董娟娟; 田婷婷; 陈邬锦*
来源:中国病原生物学杂志, 2021, 16(12): 1404-1408.
DOI:10.13350/j.cjpb.211209

摘要

目的 分析1株从医院污水中分离的宽裂解谱铜绿假单胞菌噬菌体的基因组信息,了解其生物学特性,为铜绿假单胞菌院内感染的治疗提供新的思路。方法 收集医院污水标本,采用双层平板法进行噬菌体分离纯化,用电镜观察其形态,测定噬菌体裂解谱、最佳感染复数(MOI)和一步生长曲线;对噬菌体进行全基因组测序分析。结果 从污水标本中分离纯化获得1株铜绿假单胞菌噬菌体YFY1,MOI指数为0.1,一步生长曲线显示潜伏期约为50 min,爆发期约为40 min;电镜观察其头部长约63 nm,尾长约10 nm,为尾部呈短棒状的肌尾噬菌体。YFY1基因长度为61 404 bp, GC含量为60.18%,其基因组注释共得到84个开放阅读框架(ORF),在注释的107个相似蛋白中有81个蛋白相似度>50%,其中64个为假设蛋白,17个为体现噬菌体功能和结构的重要蛋白。结论 YFY1是一株烈性肌尾噬菌体,该噬菌体具有多种与功能相关的蛋白,可为铜绿假单胞菌感染的生物治疗提供理论依据。