基于二代测序技术的多源遗传标记检测体系的构建与验证

作者：郭江玲; 尚蕾; 汤真; 丁光树; 李万水; 余政梁; 袁丽萍; 孙敬; 孙辉^*

来源：刑事技术, 2023, 48(02): 111-120.

DOI：10.16467/j.1008-3650.2022.0033

• 法医遗传学
• 体系构建与验证
• 二代测序技术
• 多源遗传标记
• 亲缘关系鉴定

近年来，法医实践中对复杂亲缘关系的鉴定需求越来越多，需要联合多种遗传标记进行判断，如STR、X/Y遗传标记、SNP、线粒体DNA等。二代测序技术可以将多种遗传标记纳入一个检测体系中。本文报道了开发出的一套包含29个常染色体STR、36个Y-STR、32个X-STR、71个Y-SNP以及mtDNA全基因组的检测体系DNATyperTMNGSPanel v1.0。根据DNA分析方法科学工作组(SWGDAM)的验证指南，对该体系的重复性、准确性、一致性、灵敏度、混合样本、物种特异性等指标进行了评估。结果表明，该体系分型结果与毛细管电泳的一致性为99.72%，与ForenSeq?DNA Signature Prep Kit试剂盒相重合的基因座结果均完全一致。在0.5～10 ng DNA模板量范围内无等位基因丢失，而在0.25、0.125 ng时分别出现2、9个基因座的丢失。在男女混合比例为2︰1时女性成分开始出现等位基因丢失，混合比例为9︰1、4︰1、2︰1、1︰1时，检出率分别为54.72%、81.13%、98.11%、100%，若男女混合比例为1︰4则男性成分开始出现等位基因丢失，当混合比例为1︰1、1︰2、1︰4、1︰9时检出率分别为100%、100%、90.24%、82.93%。该体系对猪、牛、鼠、食蟹猴、恒河猴的DNA几乎没有扩增发生。因此，本体系的检测通量高，灵敏度和稳定性高，分型准确性和重复性好，对混合样本的检出能力较强。通过单次检测就可同时获得父系、母系相关的遗传信息，能有效提高个体识别能力和亲权鉴定效能。

• 单位
  生命科学学院; 复旦大学