基于mt COI、Cyt b、D-loop序列的南方多鳞鱚群体遗传结构分析

作者：彭敏; 肖珊; 姚久祥; 潘传燕; 李旻; 高雪梅; 冯鹏霏; 李满园; 曾地刚; 朱威霖; 杨春玲; 蒋伟明; 陈秀荔^*

来源：水生态学杂志, 2023, 44(01): 108-116.

DOI：10.15928/j.1674-3075.202105170149

• 多鳞鱚
• 线粒体DNA
• 遗传结构
• 遗传多样性

分析中国南部沿海多鳞鱚4个野生群体的遗传多样性，为多鳞鱚种质资源保护及合理开发利用提供理论参考。基于线粒体COI、Cyt b、D-loop基因序列对福建厦门(XM)、广东阳江(YJ)、海南海口(HK)和广西北海(BH)的4个多鳞鱚(Sillago sihama)群体进行遗传结构分析。经PCR扩增和测序获得4个多鳞鱚群体195条线粒体COI+Cyt b+D-loop片段序列。结果表明，单倍型多样性指数(Hd)为0.88266～0.98785，核苷酸多样性指数(π)为0.00098～0.00257，整体Hd与π分别为0.92784和0.00158。遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.00075～0.14888和1.429205～333.0833。将4个地理群体分成不同组合进行AMOVA分子方差分析，结果显示，4个群体内变异比例为93.33%，南海群体和东海群体的组内变异比例为86.57%，琼州海峡东西群体的组内变异比例为94.49%。基于COI、Cyt b和D-loop的分析结果，厦门群体和北海、海口、阳江群体间存在中等程度的遗传分化，可作为两个管理保护单位进行保护。

• 单位
  广西壮族自治区水产科学研究院; 广西壮族自治区水产引育种中心; 广西壮族自治区水牛研究所