家蚕茧层率相关基因筛选及其功能分析

作者：任晓晓; 孙运朋; 卿卓; 杨万军; 罗朝斌^*

来源：福建农业学报, 2022, 37(07): 841-849.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2022.007.004

• 家蚕
• 茧层率
• BSA-seq
• 基因注释

【目的】挖掘家蚕茧层率相关基因，以期为家蚕茧层率性状分子遗传改良提供参考依据。【方法】以多丝量家蚕品种菁松和中丝量家蚕品种芙蓉为亲本构建BC1代分离群体。在BC1代雄性群体中挑选极端高/低茧层率个体构建子代DNA混池，运用BSA-seq方法对茧层率关联区域进行定位，并运用BLAST软件对关联区域的编码基因进行GO和KEGG等数据库注释及功能预测。【结果】重测序数据与家蚕参考基因组平均比对率为98.86%，平均基因组覆盖度为95.79%(1×)和88.63%(5×)；变异检测共获得26 557 646个SNPs；?(SNP-index)定位到3个与茧层率显著相关的区域，分别为Chr.2:4 430～4 930 kb、Chr.4:12 350～12 920 kb和Chr.13:3 230～3 730 kb，共包含70个编码基因。通过GO与KEGG注释，有58个基因注释到GO数据库，涉及生物过程、分子功能和细胞组分三大类；有19个基因注释到KEGG通路，分布于34个代谢通路中。通过KEGG代谢通路分析，筛选出10个可能对家蚕茧层率有重要调控作用的基因，推测其参与了家蚕丝腺细胞运动、能量代谢和蛋白质合成加工。【结论】运用BSA-seq方法在家蚕第2、4和13号染色体上定位到与茧层率关联的区域，筛选到10个可能与茧层率密切相关的候选基因，为茧层率关键调控基因精细定位及克隆奠定基础。

• 单位
  贵州省农业科学院