StTatC生物信息学分析及马铃薯遗传转化

作者:韦秋燕; 郭江波; 胡妍; 李霞; 郑秋云; 简磊; 裴海霞; 邵玉涛; 辛翠花
来源:分子植物育种, 2023, 1-14.

摘要

双精氨酸蛋白转运系统(twin-arginine translocation system, Tat)存在于原核生物和植物细胞器中,并将正确折叠的蛋白质转运通过细胞膜。Tat系统包含TatA、TatB和TatC、3个组成部分。关于TatC在细菌中已得到广泛研究,而在植物中的相关研究甚少。本试验以马铃薯cDAN文库为模板,克隆StTatC基因全长,并通过生物信息学在线数据库对蛋白质结构和功能进行预测,利用CRISPR/Cas9技术来获得StTatC基因编辑的马铃薯。结果表明:StTatC基因的cDNA全长为1 056 bp,编码351个氨基酸;预测显示:StTatC蛋白有33个位点发生了磷酸化,属于6次跨膜螺旋的疏水性蛋白;二级结构与三级结构分析结果表明该蛋白由50.71%的α-螺旋、12.82%的延伸链和36.47%的无规则卷曲组成;通过农杆菌介导的方法成功获得了pKSE401框架和Cas9阳性的转基因马铃薯。该研究结果为实验室进一步分析StTatC功能提供了基础。