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摘要
利用CodonW 1.4.2和在线软件CUSP分析非洲菊转录组13 769条编码序列的密码子碱基组成、同义密码子相对使用度和密码子偏好性，并通过中性绘图分析、ENC-plot和PR2-plot分析影响密码子偏好性的因素。结果表明：非洲菊编码基因序列的密码子偏好性整体偏弱，影响密码子偏好性的主要因素为突变，同时确定UUG、UUU、UAU、AUU、UGU、GUU、AGA、GGU、UCU、UCA、CCA、ACC、GCU等13个最优密码子，最优密码子偏好以A/U结尾。本研究为进一步明确非洲菊密码子进化特征和遗传转化中最优密码子的选择提供参考依据。
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