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摘要
目的通过非标记蛋白质组学技术研究肺腺癌中蛋白质表达。方法选取北京大学人民医院5例未经治疗的肺腺癌患者, 提取肿瘤组织和配对癌旁组织的总蛋白, 通过高效液相色谱-质谱联用技术进行质谱分析。质谱原始数据使用Maxquant软件进行查库和非标记定量分析。Maxquant所得的查库文件使用Perseus软件进行分析。肺腺癌肿瘤组织与配对癌旁组织进行配对t检验, 筛选出差异表达蛋白后并对差异蛋白进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析, 以P<0.05为差异有统计学意义。结果通过数据库比对获得11 295条多肽, 分别对应于908个蛋白, 其中312个蛋白在肺腺癌中存在显著差异表达, 110个蛋白表达上调, 212个蛋白表达下调。肺癌中上调倍数最高的为铁蛋白, 下调倍数最高的为COL6A3。GO分析提示肺腺癌中差异表达的蛋白主要富集的分子功能为RNA binding。KEGG通路分析也证实剪接体通路在差异表达蛋白中显著富集。结论通过非标记蛋白质组学技术发现312个在肺腺癌中显著差异表达的蛋白质。
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