高职院校校企合作长效运行机制构建的影响因素众多,文章从影响校企合作最核心、最基础的两个主体——企业和院校角度出发,分析了影响合作运行机制的主要因素,并据此从院校和企业的观念转变,健全合作决策机制,加强合作规范管理,加强院校内涵建设,提升合作执行能力等方面提出了当前构建校企合作长效运行机制的相关对策。