芥蓝MAM基因家族成员鉴定、分析及表达

作者：陈家璇; 陈泽源; 赵怡娇; Wang-Pruski Gefu; 郭容芳^*

来源：应用与环境生物学报, 2022, 28(02): 491-497.

DOI：10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.11023

• 芥蓝
• MAM基因家族
• 芥子油苷
• 生物信息学
• 表达分析

在甘蓝（Brassica oleracea）基因组中鉴定了10个芥蓝（Brassica alboglabra）MAM家族基因，进行生物信息学分析并利用qRT-PCR检测BoMAM在芥蓝6个部位的表达情况.理化性质分析表明，10个BoMAM蛋白序列长度为191-623 aa，相对分子量为21 385.73-67 608.93，理论等电点pI介于5.70-9.43之间；拟南芥（Arabidopsis thaliana）、番茄（Solanum lycopersicum）、芜青（Brassica rapa）、油菜（Brassica napus）和芥蓝的MAM基因家族系统进化树分析显示MAM家族基因可分成2类4个亚家族，物种中MAM基因的亲缘关系符合期望的物种间系统进化关系；MEME分析表明10个BoMAM基因都具有HMGL-like结构域的保守基序结构；染色体定位和进一步分析表明芸薹属全基因组三倍乘事件对BoMAM家族的形成起到重要作用；启动子分析表明BoMAM启动子区域中包含大量光响应、激素响应和逆境响应相关顺式作用元件；qRT-PCR结果表明成员BoMAM1/2/7在种荚中的表达极高，BoMAM8/9在各部位中均有表达；相关性分析结果显示，BoMAM1与BoMAM2、BoMAM1与BoMAM7、BoMAM2与BoMAM7、BoMAM3与BoMAM8、BoMAM8与BoMAM9基因两两之间呈极显著相关（P <0.01），表明MAM基因相互间密切相关，可能存在协同作用.本研究表明全基因组加倍、串联重复和片段丢失可能是BoMAM家族演变的动力，且家族成员可能受到光、激素和逆境调控而参与芥子油苷合成.（图5表3参43）

• 单位
  福建农林大学