大豆UBC家族基因鉴定与生物信息分析

作者：王宁; 张颖; 杨尚君; 王璐瑶; 唐斗; 杨明亮; 齐照明^*; 刘春燕^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-11.

• 大豆
• 生物信息学
• UBC基因家族
• 表达分析

UBC家族基因已被认证参与植物生长发育过程中的多个重要生理过程。本研究对大豆中UBC基因家族的定位信息、蛋白结构、保守基序分析、顺势作用元件、物种内共线性关系、基因表达模式，还有与其他物种的系统进化树中的同源基因进行了研究和分析。结果表明，鉴定到的六个大豆UBC家族基因CDS、氨基酸、亲疏水性、蛋白二、三级结构等高度相似，甚至完全相同，比如GmUBC5和GmUBC6因氨基酸序列相同而使多个蛋白特性一致。系统进化树分析中，六个基因全都在同一个分支上，说明其高度同源，且都互相存在共线性关系，启动子区域的分析表明GmUBC家族基因多受与植物激素、逆境胁迫等相关元件调控，除了GmUBC1，另外五个基因的基因表达模式呈现一致，都是子粒较低，叶、花、根和根瘤表达量高，GmUBC1则表现出相反的表达模式。因此，通过对大豆UBC家族基因及其不同物种同源基因开展生信分析，挖掘其特性和影响其特性的相关因素，为之后关于UBC家族基因的深入研究奠定了坚实的理论基础。

• 单位
  东北农业大学; 黑龙江省农业科学院