油茶闽43叶绿体基因组序列特征及其近缘物种亲缘关系分析

作者：王小薇; 陈世品^*

来源：福建农业科技, 2023, 54(01): 9-17.

DOI：10.13651/j.cnki.fjnykj.2023.01.002

• 油茶
• 叶绿体基因组
• 长重复序列
• 系统发育树

为了探究油茶闽43与山茶属近缘物种间叶绿体基因组的差异以及进化关系，利用基因组学分析方法，对油茶闽43与其他近缘山茶属物种叶绿体基因组进行比较分析。叶绿体基因组结构特征分析结果显示：9种山茶属物种的叶绿体基因组大小为156 902～157 567 bp,有130～136个基因。REPuter分析发现，这9种山茶属物种的长重复序列类型均为P和F,通过MISA软件确定9种山茶属物种的SSR数量为52～71个，其中闽43的SSR数量为65个。通过IR边界分析，白毛茶和油茶闽43与其他3种属内物种的边界基因有较为明显差异，同时通过核苷酸多态性分析，检测出叶绿体基因组共有5个高变区，分别为psbK～atpA、rpoB～psbD、rps4～ndhJ、ycf1、ndhF～rps12～exon1。并从系统发育树的结果得出，油茶闽43与落瓣油茶的亲缘关系最近。该研究可为普通油茶种群遗传结构提供基础，为提高普通油茶的产油量以及优良品种的选育提供理论依据。

• 单位
  福建农林大学