裸燕麦种质遗传完整性SSR分析中样本量的研究

作者:杨苗苗; 卢萍; 刘俊青; 李鸿雁; 黄帆; 李俊; 王欣欣; 席领军
来源:中国草地学报, 2017, 39(03): 31-37+102.
DOI:10.16742/j.zgcdxb.2017-03-05

摘要

利用SSR分子标记技术分析裸燕麦品种定燕9号和燕科1号的不同样本量群体对遗传参数的影响,确定适宜样本量。以10、20、30、40、50、60、70、80、90为样本量梯度,对不同样本量群体的等位基因数、有效等位基因数、香农指数等遗传参数的变化趋势进行研究,结果表明:用20对SSR引物对定燕9号、燕科1号的90个单株进行扩增,分别检测到43个、32个等位基因,平均每个位点检测到2.09个、1.60个等位基因。样本量大小与等位基因数、多态位点百分率相关。两个材料的样本量分别大于70和50时,等位基因数、多态位点百分率的"S"形拟合曲线变化趋于平缓,其他遗传参数的标准差减小。因此,定燕9号、燕科1号遗传完整性SSR分析的适宜样本量为70和50,确定裸燕麦种质在进行遗传完整性研究时所需的样本量为70。

全文