桃NHX基因家族的全基因组鉴定与表达分析

作者：李淼; 李桂祥; 刘伟; 高晓兰; 王孝友; 张安宁^*

来源：山东农业科学, 2021, 53(12): 8-16.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2021.12.002

• 桃
• NHX基因家族
• 全基因组
• 基因表达

本研究利用生物信息学方法从桃全基因组数据库筛选出7个NHX反向转运体,并对其序列特征、基因结构、进化关系、亚细胞定位、组织表达谱和盐胁迫响应性进行综合分析。结果表明,7个桃NHX具有清晰的亲缘远近关系;5个桃NHX(NHX1,NHX4～NHX7)基因在结构等方面具有相似性,亲缘关系较近,而与NHX2和NHX3亲缘关系较远。7个桃NHX蛋白在N端具有明显的跨膜结构区域。顺式元件分析表明,桃NHX基因家族上游启动子区域包含与光信号、激素、逆境胁迫及分生组织表达相关的顺式作用元件。qRT-PCR分析结果显示,大多数桃NHX家族成员在茎中表达较多;所有桃NHX成员对外源盐处理具有响应性。

• 单位
  山东省果树研究所