新型冠状病毒南非B.1.351变异株的分离与分子特征分析

作者：郑焕英; 张欢; 陆靖; 欧阳方竹; 邹丽容; 胡瑶; 李振翠; 黎薇; 李柏生; 何剑锋; 柯昌文; 邓小玲^*

来源：病毒学报, 2021, 37(03): 534-540.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003978

• 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)
• 病毒分离
• Vero-E6细胞
• 全基因组序列

2020年12月广州市第八人民医院收治了1例南非输入性COVID-19病例,经检测为SARS-CoV-2核酸阳性的实验室确诊病例。本研究使用Vero-E6细胞,对该病例咽拭子样本进行病毒分离,逐日观察,咽拭子接种的细胞管3d开始出现细胞融合样细胞病变(Cytopathic effect,CPE),5d出现完全CPE后再进行第二代接种,2d出现病变,提取核酸进行鉴定,为SARS-CoV-2阳性。第2代复传的SARS-CoV-2病毒株TCID50测定结果为5.5log TCID50/0.1mL～5.8log TCID50/0.1mL。对分离毒株经采用三代测序成功获得全基因组序列,进化分析结果为与参考毒株Wuhan/Hu-1/2019相比共发生30个碱基的变异、18个氨基酸的突变和18个碱基的缺失,比对结果显示分离到的毒株为SARS-CoV-2南非B.1.351变异株。

• 单位
  广东省疾病预防控制中心