海南稻作区稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异监测与多样性分析

作者：危艺可; 王倩; 吴伟怀^*; 陆英; 贺春萍; 梁艳琼; 易克贤^*

来源：植物保护, 2023, 49(02): 57-64.

DOI：10.16688/j.zwbh.2021682

• 稻瘟病菌
• AvrPik等位基因
• 多样性

海南省地处热带。由于具有国内其他地区无可比拟的光温资源优势，每年有大量的水稻材料在南繁区繁育与种植，给稻瘟病菌的变异及传播带来了极大的便利。自20世纪70年代以来，Pik等位基因已被广泛地用作水稻抗稻瘟病育种的主要抗源。为了解海南稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异及多样性，本研究从海南稻作区采集穗茎瘟病样，通过单孢分离获得100株稻瘟病菌株。利用AvrPik基因特异性引物扩增病原菌DNA,所得PCR产物经克隆、测序后与参考序列进行比对分析。结果从100株菌株中鉴定出AvrPik＿A、AvrPik＿B、AvrPik＿D、AvrPik＿E和AvrPik＿F共5种等位基因类型。其中AvrPik＿D类型最多，出现频率为50.00%;其次为AvrPik＿E类型，出现频率为32.08%;第三为AvrPik＿B类型，出现频率为8.49%。在AvrPik等位基因核苷酸多样性方面，非信号肽区域多样性要明显高于信号肽区域。就群体受到的选择压而言，南繁种植区与常规种植区的稻瘟病菌群体的Ka/Ks值均大于1,分别为2.703 1和1.236 6,表明，无论是南繁区还是常规种植区，AvrPik等位基因均受到了强烈的正选择压，且南繁区群体受到的选择压更强。上述5种不同基因型的代表菌株中菌株20MG48 (AvrPik＿F)长势最快，其产孢量却最少。本研究初步明确了海南稻作区AvrPik等位基因的群体结构，为本稻作区抗性品种的布局以及抗瘟育种计划提供参考。

• 单位
  中国热带农业科学院环境与植物保护研究所; 海南大学