高通量测序技术分析青海藏羊初乳和常乳微生物多样性

作者：张莉莉; 崔占鸿; 孙璐^*; 刘书杰^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(05): 129-135.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220526-04

• 藏羊
• 初乳
• 常乳
• 微生物多样性
• 功能预测

为探究藏羊初乳和常乳的微生物组成及多样性，本试验选取体况良好、2～3胎次的藏羊6头，采集初乳（C）和常乳（OM）。基于高通量测序技术对2组乳样的16S rDNA的V4区进行分析，选用PICRUSt进行功能预测。结果显示：97%的一致性共得到3 413个OTUs，微生物Alpha多样性指数在藏羊常乳中高于藏羊初乳（P<0.05）。变形菌门（Proteobacteria）和厚壁菌门（Firmicutes）是2组乳样中丰度最高的2种菌门，藏羊初乳中2种菌门丰富度分别为77.61%和11.66%，常乳中为71.65%和17.43%。在属水平上，2组乳样的优势菌属均为假单胞菌属（Pseudomonas）、丛毛单胞菌属（Comamonas），且藏羊初乳中假单胞菌属和乳杆菌属（Lactobacillus）丰度高于常乳。16S rDNA基因KEGG水平功能预测，结果发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集，初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。表明藏羊初乳和常乳微生物多样性存在显著差异，并发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集，初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。

• 单位
  青海大学