以科学事业单位科研经费管理为分析对象，阐述了科学事业单位科研经费的特点，分析了科研经费管理过程中存在的问题，并本着坚持需求导向、遵循行业规律、抓好规范管理、做好公开透明的原则，从加强科研经费预算管理、严格科研经费核算管理、实施科研项目经费全成本核算、完善科研经费绩效评价制度、健全科研经费监督机制五个方面，提出加强科学事业单位科研经费管理的对策措施，以期能够把科研经费真正用到实处，促进科学事业单位科研工作良性有序发展。
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