HBxAg反式调节基因11剪切体的克隆化及生物信息学分析

作者：尹丽; 林原; 唐泽耀; 成军

来源：中国生化药物杂志, 2011, (03): 183-186.

• 乙型肝炎病毒
• 剪切体
• 克隆化
• 生物信息学 hepatitis B virus
• spliced variant
• cloning
• bioinformatics

目的克隆乙型肝炎病毒(HBV)X蛋白反式调节的靶基因11(XTP11),获得未知功能的新基因-XTP11剪切体,对其进行生物信息学分析,探讨其结构和功能。方法从肝母细胞瘤细胞系HepG2中提取总RNA,逆转录为cDNA后,设计特异性引物克隆XTP11剪切体,生物信息学技术获得编码序列、物理化学性质、蛋白质结构和功能等基本信息。结果成功扩增出XTP11剪切体基因,生物信息学分析推定ORF为1 314个核苷酸,编码产物为437个氨基酸残基。结论此文发现并鉴定了HBV XTP11剪切体,为阐明其在HBV X蛋白致病机制中的作用提供新的研究线索。

• 单位
  北京地坛医院; 新疆维吾尔自治区食品药品检验所; 大连医科大学