枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析

作者：李继东; 倪静; 叶霞; 陈鹏; 谭彬; 张梦洋; 郑先波; 张玉; 冯建灿^*

来源：园艺学报, 2020, 47(08): 1463-1474.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0965

• 枣
• 枣疯病
• 植原体
• AP2/ERF转录因子

利用生物信息学方法,从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列,使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列,采用SMART软件预测蛋白结构域发现,枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因,其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个,另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111～692之间,分子量在12 446.87～76 154.10之间,pI在4.31～10.11之间。鉴定出的145个AP2/ERF转录因子,105个分别定位到12条染色体上,40个未能定位。在此基础上,利用嫁接病芽方法将枣疯病植原体转至健康枣植株,通过转录组测序和qRT-PCR手段,分析了AP2/ERF转录因子对枣植原体侵染的响应,在植原体侵染枣的6个不同时期,枣AP2/ERF表达数量和表达量均不相同,共有48个差异表达基因,其中ZjAP2*9、ZjERF49和ZjERF91是响应枣疯病植原体最为重要的AP2/ERF转录因子。

• 单位
  河南农业大学