摘要
目的研究RNA结合蛋白UNR在神经胶质瘤发生发展中的作用以及其发挥作用的分子机制。方法首先,利用生物信息学方法分析CGGA数据库中UNR的表达水平及其表达水平高低与病人预后的关系。采用western blot和real-time PCR方法分析胶质瘤病人组织样本和细胞株中UNR的表达水平。其次,在胶质瘤细胞株A172,HS683,LN18中转染siRNA敲低UNR,采用MTS和划痕实验检测肿瘤细胞增殖能力以及迁移能力的变化。再次,通过分析已发布的黑色素瘤UNR iCLIPseq、RNA-seq和核糖体印迹测序数据库筛选出UNR在胶质瘤细胞中可能结合的靶m RNA。利用RNA免疫沉淀和生物素标记的RNA pull down实验确认UNR可结合核糖体蛋白L9(RPL9)的mRNA。最后,通过western blot检测RPL9在胶质瘤细胞株中的表达水平,并且检测敲低UNR以后RPL9蛋白水平的变化。在神经胶质瘤细胞株A172,T98G中转染siRNA敲低RPL9,检测和肿瘤侵袭迁移有关的上皮向间充质转化有关的标志物—波形蛋白的表达变化。结果生物信息学分析UNR mRNA表达水平,发现其在恶性程度更高的胶质瘤样本中表达较高(P<0.001)。高表达UNR的患者预后较差(P=0.0177)。与正常细胞株以及正常脑组织样本相比,UNR在9株胶质瘤细胞以及患者组织样本中具有较高的表达水平(P<0.01)。敲低UNR抑制肿瘤细胞的迁移能力(P<0.05),但不影响其增殖能力。UNR可以结合在PTEN mRNA和RPL9 mRNA的3’非翻译区。敲低UNR以后RPL9的表达水平下调。RPL9在9株胶质瘤细胞中具有高表达的趋势,RPL9可以正向调控波形蛋白的表达。结论本研究揭示了RNA结合蛋白UNR在胶质瘤细胞迁移方面的功能,并且发现UNR可以结合PTEN和RPL9 mRNA的3’非翻译区并调控RPL9的表达。这为我们更近一步研究胶质瘤的发生发展提供了新思路。
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单位中国医学科学院基础医学研究所; 北京协和医学院