山西省糜子DNA分子身份证的构建

作者：薛亚鹏; 李元阳; 陈凌; 王海岗; 王瑞云^*; 乔治军^*

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2022, 42(01): 19-25.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202107017

• 糜子
• 分子身份证
• 高基元SSR

[目的]利用SSR引物对山西省的糜子种质资源进行划分和管理,通过DNA碱基上的区别,制作符合碱基引物的字符串和条形码,与糜子的种质信息结合,生成DNA分子身份证,以便快速鉴定山西省糜子的种质及其特性。[方法]以来源于山西省的20份糜子资源为材料,利用高基元SSR标记(五、六碱基)进行DNA扩增,并用软件PowerMarker 3.25和PopGen 1.32计算山西省的遗传多样性参数。利用条形码在线软件http://barcode. cnaidc. com/app/html/bcgcode128. php和在线二维码技术https://cli. im/构建DNA条形码和二维码分子身份证。[结果]20份材料在10个等位位点共检测出等位变异10个,观测等位基因为3.000 0;有效等位基因为2.541 2～2.986 2,平均为2.808 8;多样性指数为1.011 5～1.096 3,平均为1.063 3;期望杂合度为0.623 8～0.684 1,平均为0.643 3;Nei’s期望杂合度为0.606 5～0.665 1,平均为0.643 3;多态性信息含量为0.571 1～0.796 2,平均为0.696 2,14对碱基引物中有10对引物(RYW1、RYW2、RYW3、RYW5、RYW6、RYW7、RYW8、RYW10、RYW12、RYW14)扩增稳定、多态性好,可用于构建分子身份证,其中RYW1、2、3为六碱基引物,RYW5、6、7、8、10、12、14为五碱基引物。[结论]构建了20份糜子种质的DNA条形码和二维码分子身份证,可为山西省的糜子的种质资源保护及快速鉴定提供科学理论依据。

• 单位
  山西农业大学