摘要

对马氏珠母贝黑壳色选育系高(HC)和低(LC)总类胡萝卜素含量(TCC)个体之间进行转录组的差异表达基因(DEGs)分析,利用qR T-PCR对候选基因进行验证,运用靶向重测序技术鉴定候选基因PmS R-BI的SNPs,并进行TCC与PmS R-BI中SNPs的关联分析。结果显示,HC组和LC组之间共鉴定了1 025个DEGs,其中HC组PmS R-BI的表达水平显著高于LC组(P <0.05);PmS R-BI SNP位点鉴定分析发现,外显子中有7个SNPs,在5′调节区发现8个SNPs;关联分析显示,外显子中的1个SNP和5′调节区的两个SNP与TCC显著相关(P <0.05)。单倍型分析发现,PmS R-BI的SNPs含有四个单倍块,单倍块1中的CC单倍型和单倍块3中的AG单倍型显著高于其他单倍型。研究结果有助于阐明类胡萝卜素代谢的机制,并促进马氏珠母贝高含量类胡萝卜素个体选育进程。