基于单细胞测序发现心脏再灌注损伤中存在一群Fabp5+巨噬细胞新亚群

作者：乔博康; 王媛; 王绿娅; 杜杰^*

来源：心肺血管病杂志, 2021, 40(08): 868-877.

DOI：10.3969/j.issn.1007-5062.2021.08.023

• 心脏再灌注损伤
• 单细胞测序
• Fabp5
• 巨噬细胞

目的:应用单细胞测序技术,揭示小鼠心脏在缺血再灌注后浸润的巨噬细胞中存在新亚群。方法:选取C57小鼠10只以及绿色荧光蛋白(GFP)基因小鼠,通过伽马射线对C57小鼠进行照射后构建移植有GFP阳性骨髓的小鼠;选用骨髓移植成功的小鼠通过冠脉前降支结扎30 min后再恢复灌注构建心脏缺血再灌注(I/R)模型;于术后3 d处死小鼠并收集新鲜心脏组织,采用美天旎心脏组织消化试剂盒获得细胞悬液,实验分为对照组:单纯利用经典流式细胞分选技术分析I/R 3 d时心脏中的骨髓源性巨噬细胞;实验组:在流式分选的基础上通过新方法C1微流控技术进行单细胞捕获以及转录组学测序。结果:首先通过流式分选技术我们发现心脏中存在两群巨噬细胞:大量骨髓源性的巨噬细胞(CCR2+GFP+,约占80%),以及CCR2-的原位巨噬细胞(约占20%);进一步捕获单个的CCR2+GFP+细胞并构建单细胞的cDNA文库;结合测序数据饱和度以及内部对照spike-in RNA对数据进行筛选得到47个细胞的数据;经过分析发现存在两个细胞亚群,其中一群巨噬细胞高表达Fabp5。结论:通过单细胞测序发现心脏缺血再灌注过程中存在一群新的Fabp5阳性的骨髓来源的巨噬细胞亚群。

• 单位
  北京市心肺血管疾病研究所; 首都医科大学附属北京安贞医院