nifA突变的苜蓿根瘤菌在根瘤中的转录组学分析

作者：田哲贤; 邹华松; 李健; 张远涛; 刘影; 俞冠翘; 朱家璧; Silvia Rüberg; Anke Becker; 王忆平

来源：科学通报, 2006, 51(15): 1787-1793.

DOI：10.3321/j.issn:0023-074X.2006.15.009

• 转录组
• NifA
• FixJ
• 根瘤细菌

用全基因组微阵列比较了根瘤中苜蓿根瘤菌1021的nifA突变菌和野生菌的基因表达谱.分析结果表明,nifA的缺失引起601个基因的表达发生变化.这些基因分别属于生物大分子的合成代谢、三羧酸循环及呼吸代谢以及结瘤固氮过程等多个功能组,预示着根瘤中细菌的生长状态发生了显著的变化.在根瘤中,fixK以及受其激活的基因在nifA突变菌中的表达量显著高于野生菌.定量实时PCR分析表明,根瘤中fixLJ的转录水平在nifA突变菌中显著高于野生菌.通过统计学方法从13个表达发生显著变化的基因的上游调控序列中找到推测的NifA结合位点.

• 单位
  北京大学; 中国科学院; 生命科学学院; 植物分子遗传国家重点实验室