光裸星虫(Sipunculus nudus)不同发育时期卵细胞内参基因的筛选

作者：张家炜; 邬婧; 周丹; 郑哲; 王庆恒

来源：基因组学与应用生物学, 2018, 1-17.

• 发育时期
• 内参基因
• Sipunculus nudus
• 表达稳定性
• 光裸星虫
• 卵子发生
• 基因表达量
• 卵细胞

内参基因的选择对功能基因表达量的归一化处理尤为重要。为了筛选出光裸星虫不同发育时期卵子的最适内参基因,利用q RT-PCR测定了甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）、肽基脯氨酰顺反异构酶A（PPIA）、60S核糖体蛋白L10（60S-L10）、铁蛋白（Ferritin）、β-肌动蛋白（β-actin）、泛素C（UBC）、真核生物翻译起始因子（e IF）、NADH脱氢酶（NDH）、28S核糖体RNA（28S）、TATA盒结合蛋白（TBP）、18S核糖体RNA（18S）和琥珀酸脱氢酶A亚基（SDHA）共12个候选内参基因的表达水平。并通过4个程序（ge Norm、Norm Finder、Best Keeper以及Ref Finder）综合分析了各基因的表达稳定性。结果显示:（1） 12个候选内参基因均能获得特异性扩增产物,但表达情况各异;（2）对候选内参基因进行综合打分,得到候选内参基因稳定性排名为:18S>GAPDH>28S>β-actin>UBC>e IF>NDH|TBP>PPIA|Ferritin>60S-L10>SDHA。18S和GAPDH稳定性较好,可作为不同发育时期卵细胞基因表达研究的单内参基因,或最优组合内参基因。

• 单位
  广东海洋大学