黄瓜属Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

作者：江彪; 娄群峰; 刁卫平; 陈龙正; 张万萍; 陈劲枫

来源：园艺学报, 2008, (08): 1147-1154.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2008.08.008

• 黄瓜
• Ty1-copia类逆转座子
• 逆转录酶
• 异质性 Cucumis
• Ty1-copia-like retrotransposons
• reverse transcriptase
• heterogeneity

根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从黄瓜属野生种酸黄瓜(Cucumis hystrix Chakr.)和栽培黄瓜(Cucumis sativus L.)中均扩增出260bp左右的目标条带。扩增产物经纯化后克隆于pGEM-TEasy质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定,然后进行测序及序列分析,获得了21条来源于酸黄瓜和栽培黄瓜的逆转录酶序列,通过核苷酸聚类分为5个家族。这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为255~272bp,同源性范围为27.0%~98.1%。翻译成氨基酸后,有4条序列出现终止密码子突变,6条序列...