摘要
目的:探讨AMPA型谷氨酸受体亚基1(glutamate A1,GluA1)相互作用蛋白GNAI2、SRSF10对HCC药物相关靶点、预后指标及诊断模型的作用和影响。方法:蛋白质组学方法获得GluA1相互作用蛋白。Xena数据库(https://xenabrowser.net/)中获取肝细胞癌(liver hepatocellular carcinoma,LIHC)转录组数据以及对应的临床数据,保留在75%样本中表达的基因和其中原发肿瘤和癌旁组织样本用于后续分析。R语言的limma包标准流程对样本进行差异分析。对GluA1相互作用蛋白及差异基因取交集,并进行表达量分析、单因素COX分析和生存曲线分析。PDBePISA数据库验证候选蛋白集与GluA1在分子结构上的对接。string数据库分析候选蛋白集与肝癌相关药物的作用靶点。多因素COX分析患者的预后指标,logistic回归模型构建肝癌诊断模型。结果:获得6个候选蛋白,即KIF1A、GNAI2、RPL3、ARPC1A、EIF3H和SRSF10与GluA1具有很强的亲和力。其中GNAI2和SRSF10是肝细胞癌药物Regorafenib的二级作用靶点,其在单因素以及多因素COX分析中对患者的生存均存在影响(P<0.05),GNAI2(P=0.000 339),SRSF10(P=0.040 4),并且GNAI2、SRSF10在疾病组中比正常组中高。Z值分别为GNAI2:3.584、SRSF10:2.049。HR分别为GNAI2:2.38,SRSF10:1.18,均为不利预后因素,有希望作为独立于其他因素的预后指标。在肝癌患者的诊断模型中,HR系数分别为GNAI2:11.8455,SRSF10:-0.2037,且该模型在训练集上的曲线下面积为0.971,性能优异。结论:GluA1相互作用蛋白GNAI2和SRSF10是肝细胞癌治疗药物Regorafenib的二级作用靶点,意味着其可能会成为独立于其他因素的预后指标,且具备一定的诊断意义。
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单位重庆医科大学; 基础医学院