黎药胆木内生细菌群落结构多样性研究及其基因功能预测分析

作者：卜宣尹; 杨卫丽^*

来源：热带农业科学, 2023, 43(09): 58-65.

• 胆木
• 内生细菌
• 群落结构
• 多样性
• 基因功能

以海南省5个产区采集的胆木为材料，采用高通量16SrRNA测序技术分析了胆木的根、茎、叶和表皮4个组织的内生细菌群落多样性，并通过PICRUSt分析其内生细菌的潜在功能。结果表明，胆木在16SrRNAV3-V4区高质量序列片段共得到3 759 378条有效序列，划分为3 475个OUTs，内生细菌分为30门、82纲、183目、326科、764属，具有丰富的菌群多样性，组间差异显著。对内生细菌群落结构分析可知，共有优势菌属为Chloroplast＿unclassified(25.11%)、芽孢杆菌属Bacillus(15.16%)、伯克霍尔德氏菌属Paraburkholderia(7.06%)、罗尔斯通菌属Ralstonia(5.03%)、马赛菌属Massilia(4.60%)。其中，根优势菌属为芽孢杆菌属（Bacillus）、伯克霍尔德氏菌属（Paraburkholderia）、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas）、固氮根瘤菌（Azorhizobium）、根瘤菌属（Rhizobium）；茎优势菌属为Chloroplast＿unclassified、罗尔斯通菌属（Ralstonia）、马赛菌属（Massilia）、Mitochondria＿unclassified；叶优势菌属为短小杆菌属（Curtobacterium）；表皮优势菌属为赖氨酸芽胞杆菌属（Lysinibacillus）、类芽孢杆菌属（Paenibacillus）。PICRUSt分析显示，胆木不同组织内生细菌主要涉及6个生物代谢通路及36个子功能。不同组织的内生细菌基因二级功能层预测基因种基本无差异，但基因丰度具有显著差异，代谢为影响胆木植株内生细菌多样性和丰富度的重要因素。通过全面揭示胆木不同组织内生细菌多样性的变化趋势和规律，能为其内生细菌的进一步应用、充分挖掘其蕴含的丰富微生物资源奠定理论基础。

• 单位
  海南医学院; 三明医学科技职业学院