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摘要
目的通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析久坐影响成年人胰岛素敏感性的关键基因及其相关功能和机制。方法针对下载于NCBI的人类基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据集GSE9103,利用WGCNA进行模块化分析,并通过相关性分析和网络可视化确定模块内关键hub基因及其调控网络,再对关键hub基因进行基因本体GO分析和基因集富集GSEA分析。结果通过构建共表达网络,最终得到5个基因模块,其中yellow模块与久坐呈正相关,而NDUFA9为其枢纽基因;tan模块与久坐呈负相关,而MYBPC2为其枢纽基因。进一步对GO和GSEA分析发现,yellow模块基因包括NDUFA9主要发挥线粒体形成、有氧呼吸、脂肪酸降解等生物学功能并参与物质代谢、三羧酸循环、阿尔茨海默氏症、帕金森病相关通路;而tan模块基因包括MYBPC2则与骨骼肌收缩、糖原代谢、心脏发育相关。结论本研究通过构建基因共表达网络筛选出与久坐生活方式显著相关的2个关键基因模块和2个枢纽基因;这2个模块基因分别通过线粒体功能、物质代谢和骨骼肌收缩、糖原代谢而影响成年人对胰岛素的敏感性。
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单位佛山市顺德区第一人民医院; 常州工程职业技术学院; 中国医科大学附属第一医院; 南方医科大学顺德医院
