耐药肺炎克雷伯菌JM45株氨基糖苷类药物耐药比较基因组学分析

作者：朱健铭; 姜如金; 吴晋兰; 吴康乐; 张烽; 翁幸鐾; 孔海深; 张嵘

来源：中华传染病杂志, 2013, 31(6): 327-330.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2013.06.002

• 克雷伯菌
• 肺炎
• 抗药性
• 多药
• 序列分析
• 基因组学
• 氨基糖苷类

目的 了解1株多耐药肺炎克雷伯菌JM45株对氨基糖苷类药物耐药的遗传学背景.方法 采用罗氏454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),再分析氨基糖苷类修饰酶基因、16S核糖体RNA(rRNA)甲基化酶基因检测状况,并和其他已经完成全基因组测序的革兰阴性菌作比较基因组学分析.结果 最终得到肺炎克雷伯菌JM45株1条完整的基因组(染色体)序列及2条质粒序列.基因组(染色体)序列为5 273 812 bp(GC含量65.8％),质粒1序列为317 156 bp(GC含量53.0％),质粒2序列为12 209 bp(GC含量55.3％).在质粒1中发现了氨基糖苷类腺苷转移酶基因aadA2(KPN_5186)和16S rRNA甲基化酶基因rmtB(KPN_5243).由全基因组测序可见aadA2基因位于整合子中,排序为int ⅠA-dfrA12 aadA2 orf3/qacE;rmtB基因位于转座子中,排序为tnpA-TEM1 rmtB.结论 携带aadA2和rmtB基因是JM45株耐氨基糖苷类药物的主要原因.

• 单位
  浙江大学医学院附属第二医院; 南通大学; 浙江大学医学院附属第一医院; 传染病诊治国家重点实验室; 杭州市余杭区中医院; 杭州市余杭区第五人民医院; 宁波市第一医院