蓝细菌16S rRNA双甲基化酶基因ksgA的进化分析、蛋白结构预测及功能验证

作者：王婧蓝; 胡胜; 王莉; 陈雯莉

来源：华中农业大学学报, 2016, 35(06): 1-10.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2016.06.001

• ksgA
• 蓝细菌
• 双甲基化修饰
• 序列分析
• 蛋白结构预测
• SWISS-MODEL

为研究核糖体小亚基rRNA双甲基化酶基因ksgA的进化关系、蛋白结构和功能,利用MEGA 5.2软件构建了37种蓝细菌ksgA基因和16SrDNA的系统进化树,通过SWISS-MODEL分析和预测KsgA的蛋白质结构模型,并通过克隆集胞蓝细菌Synechocystis sp.strain PCC 6803、鱼腥蓝细菌Anabaena sp.strain PCC7120和聚球蓝细菌Synechococcus elongates sp.strain PCC 7942的ksgA基因对大肠杆菌ksgA突变体进行了异源互补。结果表明:ksgA基因在蓝细菌中与16SrDNA进化分支高度相似,且体现出蓝细菌进化的聚类特征;蓝细菌KsgA甲基化酶与该蛋白家族的其他蛋白质拥有共同的保守结构、催化位点和配体结合位点;克隆的3种蓝细菌ksgA基因均能在一定程度上互补大肠杆菌ksgA基因的功能。

• 单位
  华中农业大学; 农业微生物学国家重点实验室