小鼠睾丸特异表达基因TSEG-1的克隆及序列分析

作者：顾朝辉; 童强松; 曾甫清; 刘媛; 王智宇; 郑丽端; 蔡嘉斌; 蒋国松

来源：遗传, 2008, 30(03): 352-358.

DOI：10.3321/j.issn:0253-9772.2008.03.018

• 小鼠
• 睾丸
• 表达序列标签
• TSEG-1
• 生物信息学

从表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST,通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列,构建EST叠加群(contigs),Biolign软件拼接,GeneScan软件预测contigs对应的基因组序列中的外显子、内含子;;针对开放阅读框设计引物序列,采用RT-PCR从小鼠睾丸组织中克隆新基因的cDNA,分析该基因在小鼠各脏器中的mRNA表达,并对测序结果进行生物信息学分析。结果表明:在小鼠X染色体的1668~2011kb间克隆出一新基因TSEG-1,全长为510bp,开放阅读框为336bp,编码111氨基酸,分子量12.84258kDa,等电点11.4000。RT-PCR证实该基因开放阅读框正确,在小鼠睾丸组织中特异性表达,且与小鼠其他cDNA无同源性,获得GenBank登录号EU079024。功能区分析发现TSEG-1蛋白可能为一种跨膜蛋白,跨膜区位于第41~61氨基酸残基。TSEG-1基因与人类睾丸特异性组蛋白2α变异体基因有较高同源性,在TSEG-1基因5′-端非编码侧翼预测发现存在1个启动子区域,范围为680bp。TSEG-1蛋白可能有4个抗原性位点,2个特异性蛋白激酶的磷酸化位点,其亚细胞定位可能位于线粒体。小鼠睾丸特异性基因TSEG-1的克隆为进一步研究其生物学功能和表达调控奠定了基础。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属协和医院