利用GEO数据库分析结肠癌中EZH2及其相关基因的表达与意义

作者：宋达为; 黄睿; 汤庆超; 马天翼; 罗玥琛; 王贵玉; 王锡山

来源：中华结直肠疾病电子杂志, 2016, 5(06): 475-479.

• 结直肠肿瘤
• 基因表达
• EZH2
• 细胞周期
• 基因芯片

目的探讨果蝇Zeste基因增强子人类同源物(EZH2)在结肠癌的表达情况、评估对结直肠癌患者预后的意义,并分析预测与其相关的基因及细胞通路。方法通过GEO数据库下载基因芯片GSE17538数据内包含232例结直肠癌病例;结合R2平台,筛选出与EZH2表达显著相关的基因并进行GO和KEGG通路分析;通过Kaplan-Meier法绘制生存曲线,研究EZH2与患者预后、生存之间的关系。结果 232例结肠癌标本中,EZH2的表达与年龄(χ2=4.426,P=0.035)、AJCC分期(χ2=8.259,P=0.041)和分化程度(χ2=7.301,P=0.026)有关,与性别(χ2=0.622,P=0.430)无关。全部检测出与EZH2表达显著相关基因共4 305个(其中正相关2 240个、负相关2 065个),对GO及KEGG通路分析后发现其中1 509个相关基因涉及细胞周期、RNA的转录、DNA复制等多个肿瘤发生、发展过程。Kaplan-Meier法分析,EZH2的表达与患者的无病生存期有相关性(P<0.05)。结论推测EZH2可成为研究患者预后的分子标志物,为未来深入研究提供参考。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院; 哈尔滨医科大学附属第二医院; 哈尔滨医科大学