基于生物信息数据库分析含DEP结构域的蛋白质1在子宫内膜癌中的表达和预后意义

作者：赵车冬; 王敏娟; 周萍; 陈葳^*

来源：遵义医科大学学报, 2021, 44(03): 339-344.

DOI：10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2021.0055

• 子宫内膜癌
• 含DEP结构域的蛋白质1
• 表达
• 预后
• 生物信息分析

目的通过探讨含DEP结构域的蛋白质1 (DEP domain containing 1,DEPDC1)在子宫内膜癌(Endometrial cancer, EC)组织中的表达,阐明其对EC诊断和预后的意义。方法利用UALCAN在线分析工具分析DEPDC1 mRNA在EC中的表达以及与临床病理特征的相关性。利用人类蛋白质表达图谱(The human protein atlas, HPA)数据库分析DEPDC1蛋白在EC中的表达。Kaplan-Meier Plotter用于分析DEPDC1表达与EC预后的关系。采用STRING和Metascape在线分析工具探索DEPDC1相互作用蛋白网络以及功能富集。结果 DEPDC1的mRNA和蛋白水平在EC中的表达高于正常子宫内膜组织,DEPDC1基因的表达与人种、肿瘤分期、组织亚型以及TP53突变状态相关。DEPDC1的高表达与EC的不良预后相关。与DEPDC1相互作用的蛋白富集于有丝分裂、微管相关运动等生物学进程。结论 DEPDC1可能与EC的恶性表型和进展有关,可能作为EC潜在的诊断标志物和治疗靶点。

• 单位
  西安交通大学第一附属医院