探索染色质三维构象的“工具箱”研究进展

作者：林达; 张斯姮; 张智慧; 徐伟泽; 洪萍; 李国亮^*; 曹罡^*

来源：中国科学:生命科学 , 2020, 50(05): 497-505.

• 三维基因组学
• 染色体构象
• Hi-C
• DLO Hi-C
• ChIA-PET
• FISH

三维基因组学是研究基因组三维空间结构与功能的一门学科.基于不同的研究目的和生物学问题,目前发展出了各种各样的三维基因组学研究方法,这些方法对推动三维基因组学发展有积极的影响.本文以三维基因组学的提出和发展过程为线索,对三维基因组学的主要研究方法进行了系统地归类与介绍,包括基于测序技术(基于邻近连接)的Hi-C, capture Hi-C, single-cell Hi-C, DLO Hi-C, ChIA-PET, Hi-ChIP等;基于测序技术(不基于邻近连接)的ChIA-Drop, SPRITE, GAM;以及基于影像技术的seqFISH, CRISPRainbow, SABER amplifies FISH.最后,本文对染色体构象捕获技术的发展方向进行了简单的展望.

• 单位
  华中农业大学; 作物遗传改良国家重点实验室; 农业微生物学国家重点实验室