宏基因组学二代测序对结核性脑膜炎的诊断价值

作者：孔娇; 蔡青山^*; 喻义杭; 赵亚芳

来源：中华传染病杂志, 2023, 41(07).

• 基因组学
• 结核分枝杆菌
• 诊断技术和方法

目的评价宏基因组学二代测序(mNGS)对结核性脑膜炎(TBM)的诊断价值。方法纳入2020年8月1日至2022年8月31日浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心收治的99例疑似TBM患者, 对其脑脊液进行mNGS、利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测和分枝杆菌培养检测。通过比较3种检验方式的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、一致率、Kappa值评价其诊断价值, 并绘制mNGS诊断效能的受试者操作特征曲线(ROC曲线)进行分析。统计学方法采用χ2检验和秩和检验。结果 99例疑似TBM患者中, TBM者67例, 非TBM者32例。以67例临床诊断为TBM的结果为标准, mNGS诊断TBM的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、一致率、Kappa值分别为82.1%、100.0%、100.0%、72.7%、87.9%、0.748, 其中灵敏度高于利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测的50.7%和分枝杆菌培养的28.4%, 差异均有统计学意义(χ2=12.61、32.42, 均P<0.01)。mNGS检测所需时间为1.0(1.0, 2.0) d, 短于分枝杆菌培养的42.0(42.0, 42.0) d, 差异有统计学意义(Z=10.80, P<0.001)。ROC曲线分析显示, 当mNGS检测脑脊液中结核分枝杆菌序列数为1个时, 其诊断效能最佳。结论 mNGS在TBM诊断中的灵敏度和特异度均较高, 所需时间较短, 可早期用于TBM诊断。

• 单位
  浙江大学; 浙江中医药大学; 第二临床医学院